实验室需要遵守 ALCOA+ 的数据完整性原则：信息必须可归属、清晰、同步、原始、准确、完备、一致、持久和有效。这不仅适用于基于纸张的系统，也适用于实验室所使用的计算机系统和软件。此项原则至关重要，因为这些检测承担着产品放行的责任。数据的修改或丢失可能会给患者带来风险。
微生物实验室的数据完整性面临独特的挑战，从减少人为错误的角度着手可能更易于考虑数据的完整性。例如，微生物实验室的核心功能是计数生物负荷和采样板。由于这些是在琼脂培养皿上的活的微生物，我们该如何确保计数准确？我们又应该将什么视为原始数据？有一些公司为了应对这些问题，对采样板进行拍照，并使用“四眼”原则来验证原始计数。其他公司正转向使用自动计数阅读器，数据通过电子方式进行验证和存储。其他的例子包括表型微生物鉴定系统（其中生化和代谢检测根据颜色变化或浑浊度来读取）以及内毒素检测中的凝胶凝法。这些结果都是非常主观的，因为不同的技术人员可能会以不同的方式来解读结果。如果基于这些检测结果进行产品配置，将会带来准确性和复现性问题。因此，对所有微生物实验室功能进行数据完整性评估是至关重要的。
减少实验室中的人为错误将有助于提高公司的数据完整性，从而增强监管状况。为此，许多实验室正转向采用自动化设备和实验室信息管理系统 (LIMS)，因为这可以最大程度地减少手写记录和不一致的地方。简化的工作流程可以显著加快检测速度，同时提供更可靠的数据。这些数据输出是可读的、与日期和时间戳同步、可归属于操作员登录、原始、准确并且一致。数据文件可以通过电子方式保存，以保持持久、有效和完备。
FDA 最近的警告信中重申了数据完整性的重要性：“贵公司没有维护所有实验室检测的完整而准确的数据。如果没有可靠的实验室数据，就无法保证就批次放行、产品稳定性和其他药物质量方面做出适当的决策。”由于制造环境的控制状态是基于环境监测系统的，对产品放行来说至关重要。因此质控微生物实验室必须做到准确、可靠和及时地进行检测。
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